建设工程施工合同纠纷是民商事审判中的疑难复杂类型。这类案件通常涉及标的额大、法律关系复杂、专业性强等特点。

合同效力问题是首要争议焦点。未取得建设工程规划许可证、施工许可证等行政审批手续的，合同效力可能受到影响。但实务中，法院一般倾向于认定合同效力可补正。

工程价款结算纠纷是占比最高的争议类型。包括工程量认定、单价确定、措施费计取、索赔费用确认等问题。对于合同约定不明或未约定的，通常参照当地定额标准结算。

工期延误的违约责任认定也是常见争议。在认定工期延误原因时，需要综合考虑发包人指令变更、设计变更、不可抗力、承包人施工组织不力等多重因素，合理划分各方责任比例。